Chọn lọc tự nhiên tác động bằng cách ưu tiên những cá thể có kiểu hình thích nghi tốt hơn với môi trường, giúp chúng sống sót và sinh sản nhiều hơn. Ví dụ: Ở một quần thể bướm, những con có màu sắc hòa lẫn với vỏ cây sẽ có khả năng sống sót cao hơn so với những con có màu sắc nổi bật, từ đó tần số alen quy định màu sắc hòa lẫn sẽ tăng lên trong quần thể.